Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
DDR1Q08345 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
DDR1Q08345 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms