Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SLC3A1Q07837 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SLC3A1Q07837 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms