Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PDE4BQ07343 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PDE4BQ07343 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms