Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TNFRSF17Q02223 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TNFRSF17Q02223 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms