Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PLCB3Q01970 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms