Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
EXOSC10Q01780 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EXOSC10Q01780 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms