Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
MS4A2Q01362 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms