Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT1

PRCD, Progressive rod-cone degeneration protein, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCDQ00LT1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRCDQ00LT1 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms