Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDK17Q00537 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms