Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HTRA4P83105 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA4P83105 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA4P83105 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA4P83105 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA4P83105 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA4P83105 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HTRA4P83105 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HTRA4P83105 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HTRA4P83105 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms