Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IRX3P78415 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
IRX3P78415 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
IRX3P78415 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IRX3P78415 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX3P78415 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX3P78415 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX3P78415 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX3P78415 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX3P78415 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX3P78415 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX3P78415 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX3P78415 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
IRX3P78415 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
IRX3P78415 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IRX3P78415 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
IRX3P78415 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms