Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TUBB4BP68371 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
TUBB4BP68371 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms