Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ACTA1P68133 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ACTA1P68133 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms