Protein–RNA interactions for Protein: P63165

SUMO1, Small ubiquitin-related modifier 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO1P63165 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SUMO1P63165 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms