Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HERVK_113P62684 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HERVK_113P62684 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms