Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ERVFRD-1P60508 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms