Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CHMP4BP1P59074 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CHMP4BP1P59074 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms