Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP9P55211 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CASP9P55211 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CASP9P55211 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP9P55211 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP9P55211 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP9P55211 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CASP9P55211 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CASP9P55211 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CASP9P55211 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms