Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB4P54760 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms