Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBE2E1P51965 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms