Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GPC3P51654 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GPC3P51654 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GPC3P51654 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC3P51654 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC3P51654 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC3P51654 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GPC3P51654 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GPC3P51654 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GPC3P51654 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GPC3P51654 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms