Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PPT1P50897 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PPT1P50897 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PPT1P50897 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPT1P50897 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PPT1P50897 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PPT1P50897 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PPT1P50897 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PPT1P50897 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PPT1P50897 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms