Protein–RNA interactions for Protein: P49765

VEGFB, Vascular endothelial growth factor B, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFBP49765 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VEGFBP49765 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VEGFBP49765 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms