Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LMAN1P49257 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LMAN1P49257 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms