Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LHX1P48742 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LHX1P48742 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LHX1P48742 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LHX1P48742 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LHX1P48742 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms