Protein–RNA interactions for Protein: P48728

AMT, Aminomethyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMTP48728 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMTP48728 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMTP48728 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AMTP48728 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMTP48728 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMTP48728 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AMTP48728 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMTP48728 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMTP48728 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AMTP48728 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
AMTP48728 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
AMTP48728 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
AMTP48728 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AMTP48728 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AMTP48728 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AMTP48728 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms