Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UTRNP46939 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UTRNP46939 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UTRNP46939 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UTRNP46939 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UTRNP46939 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTRNP46939 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTRNP46939 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTRNP46939 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTRNP46939 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTRNP46939 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UTRNP46939 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTRNP46939 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTRNP46939 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
UTRNP46939 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UTRNP46939 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UTRNP46939 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UTRNP46939 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
UTRNP46939 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
UTRNP46939 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms