Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CDKN1BP46527 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CDKN1BP46527 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CDKN1BP46527 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms