Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
RAD52P43351 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
RAD52P43351 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
RAD52P43351 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
RAD52P43351 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD52P43351 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD52P43351 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD52P43351 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD52P43351 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD52P43351 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
RAD52P43351 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms