Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCAMP43121 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCAMP43121 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
MCAMP43121 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCAMP43121 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCAMP43121 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCAMP43121 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCAMP43121 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCAMP43121 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCAMP43121 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCAMP43121 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCAMP43121 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCAMP43121 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCAMP43121 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCAMP43121 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCAMP43121 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCAMP43121 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCAMP43121 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
MCAMP43121 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms