Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
APOBEC1P41238 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
APOBEC1P41238 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms