Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PPARGP37231 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PPARGP37231 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGP37231 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGP37231 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGP37231 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGP37231 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGP37231 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGP37231 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGP37231 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PPARGP37231 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PPARGP37231 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PPARGP37231 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PPARGP37231 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PPARGP37231 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms