Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CHRNA7P36544 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA7P36544 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms