Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DSG3P32926 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DSG3P32926 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG3P32926 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG3P32926 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG3P32926 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG3P32926 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG3P32926 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG3P32926 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG3P32926 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DSG3P32926 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSG3P32926 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSG3P32926 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSG3P32926 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DSG3P32926 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DSG3P32926 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DSG3P32926 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
DSG3P32926 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms