Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP5DP30049 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5DP30049 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms