Protein–RNA interactions for Protein: P29375

KDM5A, Lysine-specific demethylase 5A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5AP29375 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KDM5AP29375 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KDM5AP29375 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
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