Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PTPRMP28827 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTPRMP28827 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
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