Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ERCC5P28715 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ERCC5P28715 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms