Protein–RNA interactions for Protein: P28562

DUSP1, Dual specificity protein phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP1P28562 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
DUSP1P28562 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DUSP1P28562 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms