Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXD10P28358 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXD10P28358 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms