Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLD1P28340 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLD1P28340 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLD1P28340 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLD1P28340 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLD1P28340 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD1P28340 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD1P28340 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD1P28340 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD1P28340 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD1P28340 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD1P28340 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD1P28340 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD1P28340 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD1P28340 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD1P28340 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLD1P28340 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD1P28340 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD1P28340 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD1P28340 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD1P28340 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD1P28340 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD1P28340 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLD1P28340 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms