Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ITGA3P26006 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms