Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
HRCP23327 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
HRCP23327 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
HRCP23327 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
HRCP23327 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HRCP23327 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HRCP23327 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HRCP23327 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HRCP23327 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HRCP23327 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
HRCP23327 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
HRCP23327 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
HRCP23327 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HRCP23327 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HRCP23327 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HRCP23327 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HRCP23327 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HRCP23327 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
HRCP23327 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
HRCP23327 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HRCP23327 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HRCP23327 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HRCP23327 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
HRCP23327 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
HRCP23327 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HRCP23327 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
HRCP23327 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HRCP23327 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
HRCP23327 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HRCP23327 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HRCP23327 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HRCP23327 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HRCP23327 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HRCP23327 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HRCP23327 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HRCP23327 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HRCP23327 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HRCP23327 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HRCP23327 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HRCP23327 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms