Protein–RNA interactions for Protein: P21709

EPHA1, Ephrin type-A receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA1P21709 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
EPHA1P21709 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
EPHA1P21709 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms