Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PSMB1P20618 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms