Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD33P20138 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD33P20138 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD33P20138 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD33P20138 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD33P20138 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD33P20138 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD33P20138 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD33P20138 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD33P20138 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CD33P20138 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CD33P20138 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CD33P20138 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms