Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIG1P18858 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIG1P18858 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIG1P18858 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
LIG1P18858 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIG1P18858 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIG1P18858 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
LIG1P18858 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIG1P18858 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIG1P18858 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIG1P18858 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIG1P18858 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIG1P18858 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIG1P18858 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIG1P18858 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms