Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATP2A2P16615 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms