Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CREB1P16220 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB1P16220 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB1P16220 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB1P16220 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB1P16220 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB1P16220 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CREB1P16220 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CREB1P16220 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CREB1P16220 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CREB1P16220 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms