Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HPGDP15428 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HPGDP15428 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HPGDP15428 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPGDP15428 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPGDP15428 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPGDP15428 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HPGDP15428 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HPGDP15428 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms